Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl7Q03366 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms