Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gjb5Q02739 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms