Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GscQ02591 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms