Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp39Q02525 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms