Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms