Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbp1Q01514 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms