Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms