Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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