Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms