Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms