Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RhodP97348 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RhodP97348 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RhodP97348 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms