Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms