Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx3P81067 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms