Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms