Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms