Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms