Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2mP61082 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms