Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Polr2iP60898 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2iP60898 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2iP60898 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms