Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

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Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Csrnp3P59055 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrnp3P59055 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms