Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms