Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp25P57080 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp25P57080 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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