Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd38P56528 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms