Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pex2P55098 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pex2P55098 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms