Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgd1P52734 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms