Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TspoP50637 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TspoP50637 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms