Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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