Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms