Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VhlP40338 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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VhlP40338 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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VhlP40338 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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VhlP40338 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VhlP40338 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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