Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms