Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hoxc11P31313 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hoxc11P31313 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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