Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb3P28231 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms