Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PdgfraP26618 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PdgfraP26618 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms