Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pde6bP23440 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pde6bP23440 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pde6bP23440 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pde6bP23440 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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