Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms