Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms