Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms