Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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