Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms