Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms