Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms