Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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