Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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H3f3cP02301 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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H3f3cP02301 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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H3f3cP02301 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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H3f3cP02301 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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H3f3cP02301 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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H3f3cP02301 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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H3f3cP02301 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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H3f3cP02301 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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H3f3cP02301 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3cP02301 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3cP02301 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3cP02301 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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H3f3cP02301 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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H3f3cP02301 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms