Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BlmO88700 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BlmO88700 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BlmO88700 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BlmO88700 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BlmO88700 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BlmO88700 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BlmO88700 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BlmO88700 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BlmO88700 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BlmO88700 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BlmO88700 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BlmO88700 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BlmO88700 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BlmO88700 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BlmO88700 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BlmO88700 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BlmO88700 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BlmO88700 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BlmO88700 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms