Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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