Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms