Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f6O54917 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms