Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DffaO54786 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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DffaO54786 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DffaO54786 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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