Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms