Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EllO08856 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms