Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms